1912년 5월 1일 진산공립보통학교로 개교하였다. 1952년 5월 28일 지방분교를, 1957년 4월 3일 만악분교를, 1968년 3월 1일 석막분교를 국민학교로 각각 승격하여 분리하였다. 1981년 3월 1일 병설유치원을 개원하였다. 1989년 3월 1일 석막국민학교를 진산국민학교 석막분교로, 1991년 3월 1일 지방국민학교를 진산국민학교 지방분교로 다시 편입하였다. 1994년 3월 1일 석막·지방분교장을 본교에 통합하였으며, 1995년 3월 1일 만악국민학교를 본교로 통폐합하였다. 1996년 3월 1일 본교는 진산초등학교로 개명하였다. 1999년 9월 1일 남이초등학교 건천분교장을 통합하였다.
교육목표는 “몸과 마음이 튼튼한 학생을 기른다. 기초와 기본이 튼튼한 학생을 기른다. 자기의 소질을 계발하는 학생을 기른다. 전통 문화 위에 새로운 가치를 창조하는 학생을 기른다. 이웃과 나라의 발전을 위해 봉사하는 학생을 기른다.”이다. 교목은 느티나무, 교화는 장미이다.
1993년 3월 1일 충청남도교육청지정 과학교육 시범학교로 지정된 바 있으며, 1996년 12월 24일 학교체육진흥 우수학교로 선정되어 교육감상을 수상하였다. 한편 1996년 10월 21일 충청남도교육청지정 병설유치원 시범학교로 지정되기도 하였다.
2010년 현재 도움반(특수학급)을 포함하여 총 7학급이 개설되어 있고, 남학생 68명과 여학생 58명 총 126명의 학생이 재학 중이며, 병설유치원에는 1학급이 개설되어 있어 남자 6명과 여자 4명 등 총 10명이 재원 중이다. 교직원은 현재 교원 12명과 직원 7명 등 총 19명이 근무 중이다. 2010년 2월 17일 제95회 졸업식을 거행하였으며, 지금까지 누적된 졸업자 수는 총 5,677명에 이른다.