1946년 9월 27일에 설립인가를 받고, 1946년 11월 5일에 안계초급중학교로 개교하였다. 1948년 8월 31일 안계공립농업학교, 1951년 9월 1일 안계농업고등학교, 1973년 9월 18일 안계종합고등학교로 교명이 변경되었다. 2003년 11월 7일 학교 체제 개편과 함께 통합 인문계 고등학교인 안계고등학교로 교명이 변경되었다. 2008년 8월 28일에 기숙형 공립학교로 선정되었다.
교훈은 ‘정직과 창조’이다. 더불어 살아가는 정직하고 창의적인 인간 육성을 지향한다. 이를 위해 올바른 학생 문화 정착, 지·덕·체의 전인교육 실시, 미래사회의 적응력 신장, 사제동행 풍토 조성을 교육목표로 삼고 있다. 교목은 느티나무이고, 교화는 모란이다. 인내와 관용, 평화와 화목을 지향하며(느티나무), 부귀, 장엄, 성실을 추구한다(모란).
2008년 4월 21일에 실내골프연습장을 개장하였다. 농업고등학교 당시 농기계 실습실로 사용되던 건물을 리모델링하여 실내골프연습장을 개장, 운영함으로써 농촌학교 살리기와 특성화 교육의 새로운 가능성을 모색하고 있다. 2010년 3월 16일 현재 10학급으로 편성되어있으며, 재학생은 229명이고 교직원은 총 36명으로 구성되어있다. 2010년 2월 제59회 졸업식을 하였고, 총 13,478명의 졸업생을 배출하였다.