1946년 10월 25일 욕지공민학교로 개교하였다. 1952년 12월 9일 사립 욕지중학교 인가를 받았다. 1959년 11월 25일 공립 욕지중학교 개편 인가를 받았다. 1969년 3월 5일 현 교사로 이전하였다. 1972년부터 인근 섬 지역의 학생들을 위한 통학선이 취항하였다. 1982년 2월에 학급을 증설하여 15학급을 편성하였으며, 1999년 3월에 학급을 감축하여 3학급을 편성하였다.
교훈은 ‘머리엔 새로움이 가슴엔 따뜻함이’이며, 교목은 은행나무, 교화는 동백꽃이다. 교육목표는 바른 품성과 즐거움으로 꿈을 실현하는 창의적 인재를 육성하는 것이다. 욕지도의 중심에 위치하며, 인근 지역 학생의 원활한 등·하교를 지원하기 위하여 통학선을 운영하고 있다.
독서·논술교육을 특색 교육활동으로 선정하여 다양한 프로그램을 운영하고 있다. 교지 및 교육활동 사진첩인 『고매 넝쿨』을 발간하고 있다. 2010년 4월 현재 3학급으로 구성되어 있으며, 학생 34명, 교직원 14명이다. 2010년 2월 제58회 졸업식을 하였으며 총 5,298명의 졸업생을 배출하였다.