기독교정신과 민주교육의 근본이념을 바탕으로 국가사회 및 교회에 봉사할 실천적 지도자 및 교역자의 양성을 목표로 설립되었다.
한일장신대학교는 1922년광주에서 여선교사 쉐핑(E. J. Shepping)에 의해 여성을 위한 전도부인(Bible Woman) 양성교육을 시작한 것을 그 모태로 하며, 그 다음 해인 1923년 9월 4일 전주에 설립된 여성성경학교 ‘한예정성경학교’개교를 시초로 삼고 있다.
전주 한예정성경학교는 1952년 전주 고등성경학교로 인가받아 보다 수준높은 교육을 실시하던 중 1956년 ‘전주 한예정성서신학원’으로 교명을 변경하고 전라북도 교육위원회로부터 고등학교령에 의한 각종학교로 허가받았으며, 1961년 4월에는 전주 한예정성서신학원의 ‘한’자와 광주 이일성서신학교의 ‘일’자만을 따서 ‘전주한일신학원’으로 합병하여 미국인 선교사 고인애 여사가 초대교장으로 취임하였다.
1980년 교육부로부터 정규 4년제 신학대학과 동일한 학제인가를 받았으며, 1984년 11월 교육부로부터 4년제 대학졸업과 동등한 학력인정을 받았다. 1993년 대학의 장기적 발전을 위해 현 위치(전북특별자치도 완주군 상관면 신리)로 캠퍼스를 이전했으며, 1998년 9월 대한예수교장로회 제83회 총회로부터 총회직영신학대학으로 허락받고 ‘한일장신대학교’로 교명을 변경했다.
2000년 3월 14일 양궁부를 창단해 국제적인 수준의 양궁선수를 배출하고 국내 · 외 각종 대회에 출전, 창단 직후부터 개인전과 단체전에서 우승을 차지하며 대학양궁계에 돌풍을 일으켰다. 2002년 사회복지학문분야평가결과 4개영역중 2개영역에서 “최우수대학”, 1개영역에서 “우수대학” 판정을 받아 기독교정신에 입각한 봉사자 교육의 요람이라는 명성을 드높였다. 2003년 교육인적자원부로부터 수검한 ‘장애학생교육복지지원실태평가’에서 “우수대학”으로 선정돼 전국 186개대학 중 12위, 전남 · 북지역대학중 1위를 차지하는 성과를 거뒀다.
2005년 일반대학원 석 · 박사과정(입학정원 18명) 설립 승인을 받아 2006년도부터 석사과정 신학과와 기독교사회복지학과에 각 5명, 박사과정 신학과와 사회복지학과에 각 4명을 선발했다. 2005년 대학장애학생교육복지지원평가 결과 ‘우수대학’으로 선정돼 2003년에 이어 2년 연속 우수대학 선정이라는 쾌거를 이뤘다. 특히 선발 및 교수 · 학습영역 ‘최우수’, 시설 · 설비영역에서 ‘우수’ 판정을 받아 전국대학 9위를 기록했다. 한국대학교육협의회가 주관하여 실시한 2006 제2주기 대학종합평가결과 ‘발전전략 및 비전영역’ 최우수, ‘교육여건 및 지원체제영역’ 우수 평가를 받았다.
2008년 12월 현재 한일장신대학교는 4개 학부 13개 전공 5개 대학원을 갖춘 총회 직영 신학대학교로서 제2의 도약을 펼치고 있다.
2008년 12월 현재 신학부에 신학ㆍ기독교교육학ㆍ기독교상담학ㆍ선교학 전공, 사회복지학부에 사회복지학ㆍ재활복지학ㆍ노인복지학ㆍ복지상담학 전공, 인문사회과학부에 영어영문학ㆍ사회경제학ㆍ사회복지기관경영학 전공, 예술학부에 음악ㆍ교회음악학, 미술치료학 전공이 있어 전체 4개 학부에 13개 전공으로 구성되어 있다.
대학원으로는 한일신학대학원ㆍ일반대학원ㆍ아시아태평양국제신학대학원ㆍ기독교사회복지대학원ㆍNGO정책대학원이 있으며, 부속기관으로는 정보문헌관ㆍ생활관ㆍ출판부ㆍ학보사ㆍ방송국ㆍ학생생활상담소ㆍ교수학습지원센터ㆍ장애학생지원센터가 있다.
부설연구기관으로는 기독교종합연구원 산하에 기독교교육연구소ㆍ기독교어문학연구소ㆍ디아코니아연구소ㆍ아시아선교연구소ㆍ예배와음악연구소ㆍ전문목회연구소ㆍ조형미술연구소ㆍ지역복지자원개발연구소ㆍ한일성경교육연구소ㆍNGO정책연구소가 있으며, 부설교육기관으로 기독교평생교육원과 한일디지털교육원, 청해설교클리닉센터, 평신도대학원이 있다. 부설사회복귀시설에 한사랑이 있으며, 그밖에 산학협력단이 있다.
2008년 8월말 현재 재학생수는 학부 1,300명과 대학원 347명 등 1,647명이며, 교원수는 전임교원 39명 등 모두 57명이다. 교훈은 ‘진리의 탐구ㆍ자유의 구현ㆍ사랑의 실천’이다.
매년 4월과 10월에 한일한마당과 가을문화제라는 대학축제가 열리고, 고벨화찬양선교단ㆍ메아리몸찬양선교단ㆍ건초더미선교회ㆍ열손가락ㆍ예수전도단ㆍ참소리ㆍ한태랑ㆍ해밀ㆍCCCㆍDSMㆍQT 등 동아리활동을 중심으로 학생활동도 활발하다.