전신은 1962년에 충주시 용산동에 2년제의 충주공업초급대학이다.
1966년 5년제의 충주공업고등전문학교로, 1974년에 2년제의 충주공업전문학교로, 1979년에는 충주공업전문대학으로 개편되었다. 1993년에 4년제의 충주산업대학교로 개편되고, 1996년 산업대학원을 개설하였고, 1997년에 부설 사회교육원을 개원하였다.
2006년 3월 국립청주과학대학을 증평캠퍼스로 통합하였으며 2012년 3월 1일 한국철도대학교와 다시 통합하여 한국교통대학교로 변경되었다. 구 충주대학교는 현재 한국교통대학교 충주캠퍼스로 운영되고 있다.