1963년 한국자연 및 자연자원보존학술조사위원회로 발족하여 1965년 한국자연보존위원회로 변경되고, 1969년 사단법인 한국자연보존연구회로, 1974년 한국자연보존협회, 1998년 3월 한국자연보전협회로 개칭되었다가, 2006년 1월 한국자연환경보전협회로 개칭되었다.
협회의 사업은 ① 자연 및 자연자원의 보존과 연구 및 관리에 관한 사업, ② 자연과 자연자원 보호에 관한 계몽 및 간행물 발간사업, ③ 동식물 증식 및 이용에 관한 사업, ④ 국내외 관계기관 및 기구와의 유대사업 등이다.
이에 따라 협회는 비무장지대의 동식물 생태를 조사하고 낙동강 하류 철새도래지의 실태를 조사하여 철새보호의 기본자료를 마련하기도 하였다. 1967년에는 국제자연보존연맹에 가입하여 국제 간의 정보를 교환하고 있으며, ≪자연보존≫지를 발간하고 있다.