신해박해는 1791년(정조 15) 전라도 진산에서 조상 제사 문제로 발생한 박해로, 신해사옥 또는 진산사건이라고도 한다. 진산의 윤지충이 모친의 상을 당해 외종형 권상연과 함께 신주를 불태우고 제사를 지내지 않아 체포되었고, 신앙을 증거하며 순교했다. 이로 인해 서울과 충청도에서도 박해가 일어났으나, 대부분의 신자들은 배교하고 풀려났다. 이 박해를 계기로 양반 신자들이 교회를 떠나고 중인 이하 신분층이 그들을 대신하게 되었으며, 천주교와 서양 과학기술에 대한 배척이 심화되었다.