구강악안면의 건강증진을 통하여 국민건강 증진에 이바지하고 관련 학회의 연구 및 봉사사업 수행을 목적으로, 1959년 6월에 '대한구강외과학회'라는 이름으로 창립되었다. 1975년에는 학회지를 창간하였고, 1984년 4월에 '대한구강악안면외과학회(Korean Academy of Oral & Maxillofacial surgery)'로 명칭을 바꾸었다. 1986년에는 일본구강외과학회와 자매결연을 맺었다. 1994년에는 학회 명칭을 '대한구강악안면외과학회 (Korean Association of Oral & Maxillofacial Surgeons)'로 변경하였다.
2000년에는 "제 4차 아시아구강악안면외과학회"를 제주도에서 개최하였다. 2003년에는 학회지가 한국연구재단 등재학술지에 선정되었다. 2011년에는 칠레 산티아고에서 개최된 국제구강악안면외과학회 상임이사회에서 서울이 2017년 제 23차 국제구강악안면외과학회 개최지로 선정되었다. 2019년부터는 7월 21일을 '턱얼굴의 날'을 제정하여 대국민 구강 건강 증진을 도모하고 있다. 2022년에는 "15차 아시아구강악안면외과학회"를 개최하였다. 2024년에는 학회가 사단법인 인가를 받았다.
학회지 『대한구강악안면외과학회지』를 발간하고 있으며, 이 학회지는 SCOPUS에 등재되었다.