1946년 9월 24일 대정공립초급중학교로 인가를 받고 1946년 11월 8일 1학년 3학급, 2학년 1학급으로 개교하였다. 1950년 8월 31일 대정중학교로 개편하였으며 1951년 5월 5일하모리 778번지로 교사 이전하였다. 1952년 3월 21일 대정고등학교 병설인가를 받아 1952년 6월 2일 대정중고등학교로 개편되었다.
1964년 3월 16일 대정여자중고등학교를, 1979년 2월 1일 대정고등학교를 분리하였다. 1984년 3월 1일 대정여자중학교를 통합하였다. 2002년 2월 8일 축구부를 창단하였고, 2005년 7월 22일 중국 지린성 훈춘시 제6중학교와 자매결연 및 교류협정을 맺었다.
조화롭고 지혜로우며 창조적인 사람을 기르는 교육목표아래, 교훈은 ‘참되고 부지런하며 생각을 새롭게 하는 사람이 되자’이며 교목은 소나무, 교화는 동백꽃이다. 1988년 장학활동 모범학교로 교육부장관 표창을 받았고 1990년 특수학급 1학급을 인가받아 현재 운영 중이다.
2000년 정보화 기술 활용 최우수 학교로 교육감 표창을 받았고 2002년엔 학교 경영 우수학교 제주도 서귀포 교육청교육장 표창을 받았다. 2004학년도 학교평가 최우수 학교로 선정되었고 2006년에 제주도 체육대회 중등부 축구와 수영에서 우승하였고 2007년 제 16회 교육감기 장거리달리기대회에서 남중부 우승을 하며 활약이 활발하다. 특색 교육활동으로 TOPS PROGRAM(교사, 학부모, 학생이 함께하는 학력증진 프로그램)을 운영하며 자기주도적 학습능력을 향상시키고 무학년제 영어 영재반 운영과 수준별 이동수업으로 학력을 신장시키고 있다.
2010년 3월 3일 현재 16학급으로 편성되어 있으며, 재학생은 532명이고 교직원은 총 52명으로 구성되어 있다. 2010년 2월 제63회 졸업식을 하였고, 졸업생 총 16,350명을 배출하였다.