1948년 9월 20일 청송공립농림중학교로 개교하였다. 1951년 청송중학교로 개칭하였으며, 청송중학교 부설 초등교원 양성소를 설치 인가받았다. 1954년 청송고등학교가 개교하였다. 1986년 본관교사 27교실을 완공하였으며, 1996년 체육관 준공, 1999년에는 특별실 3실을 증축하였다. 2008년 8월 29일 기숙형 공립고등학교로 지정되었다.
‘올바른 인성과 창의력을 지닌 인재 육성’이라는 교육목표 아래 교훈은 ‘성실 협동 봉사’로 삼고 있으며, 느티나무를 교목으로, 목련을 교화로 지정하고 있다. 2004년 도서관이 신축되었고, 2007년 농산어촌 우수고로 지정되었다. 2007년도 이후 농산어촌 우수교, 기숙형공립고, 학력관리 중심학교로 지정받아 학생 교육에 필요한 현대식 교육 환경 개선 사업을 완료하고 기숙사를 준공하여 내실있는 교육프로그램을 운영하고 있다.
또한 학생들의 학력향상을 위해 주요 교과의 맞춤형 개별학습(맨토링)실시, 인터넷강의 학습, 사이버가정학습, 영어회화 동아리교실, 원어민과 영어수업, 사제동행 독서교실 등 다양한 방과후학교 프로그램을 개발하여 운영하고 있다. 또한 미래사회에 필요한 재능과 인성함양을 위해 명사초청 강연회, 해외문화 탐방, 국내 명문대학 탐방, 예술 문화체험, 오케스트라 초청 연주회 개최 등으로 체, 덕, 지를 갖춘 전인적인 인재양성에 초점을 맞추어 심도있는 교육을 실시하고 있다.
2010년 3월 현재 특수학생 2명을 포함 총 109명의 학생이 재학 중이며, 25명의 교직원이 재직 중이다. 2010년 제60회 졸업식을 하였고, 총 7,209명의 졸업생을 배출하였다.