1946년 10월에 서천초급중학교로 설립되어 초대교장에 고봉익이 취임하였다. 설립당시 3년제 6학급으로 편성하여 같은해 12월에 서천산업조합청사를 빌려 개교하였으며, 1947년 9월에 당시 심상소학교였던 현재의 서천중학교 위치로 이전하고 1949년 7월에 제1회 졸업생 91명을 배출하였다.
학제변경에 따라 1953년 5월 서천중학교와 서천고등학교로 개편되어 고등학교에 보통과 3학급을 편성하였다. 1961년 12월에 남녀공학 보통과 6학급의 인가를 받았고, 1964년 5월에는 서천여자중고등학교가 분리, 이전됨에 따라 남자 중고등학교 병설로만 운영되었다.
1974년 3월 서천중학교와 분리되어 현재의 위치에 신축교사를 건립, 이전하여 오늘에 이르고 있다.
2010년 현재 특수 2학급을 포함하여 각 학년별 6학급씩 총 20학급이 개설되어 503명이 재학 중이다. 교원 41명과 일반 행정직 14명 등 총 55명의 교직원이 재직 중이다.
‘미래사회를 이끄는 창의적 인재 육성’을 교육지표로 하여 ‘기초 능력을 토대로 새로운 가치를 창조하는 사람, 질서와 예절을 중시하고 공동체에 기여하는 사람, 자율과 책임을 바탕으로 개성을 추구하는 사람, 생각과 행동이 건전한 도덕적 인성을 갖춘 사람’을 교육목표로 하고 있다.
특색사업으로는 ‘농산어촌 우수고 및 연구학교 운영, 서천인재스쿨 운영을 통한 수월성 교육, 1사 1교 자매결열은 통한 교육기반 조성, 학교도서관을 활용한 독서 프로그램 운영’ 등이 있다. 이 밖에 영어특성화 교과교실제 및 그린 마일리제도 등도 운영 중이다.