본관은 해남(海南). 자는 탁영(卓榮), 호는 경산(慶山). 아버지는 군수 윤용(尹容)이며, 어머니는 영광김씨(靈光金氏)로 현감 김석주(金錫柱)의 딸이다.
일찍이 가업을 이어받아 학업을 닦았으며 벼슬이 판관에 이르렀다. 정유재란 때 성전(城田)에 이르러 적의 대부대와 만나, 종일토록 결사적으로 싸워서 적병이 후퇴할 무렵 다시 적의 후속부대를 맞이하여 싸웠으나 중과부적으로 결국 적탄에 맞아 쓰러졌다.
윤익경의 충렬을 기리는 홍문관전한 윤규백(尹奎白)의 장계와 유림들의 건의에 의하여 강진 화암사(花巖祠)에 봉안되었다. 저서로는 『경산유고』가 있다.