1942년 4월 통영공립중학교로 설립되었다. 덕보재단에서 재정을 지원받아 진명학원 교사를 이용하여 개교하였으며, 수업연한 5년에 5학급 정원 250명으로 출발하여 50명이 입학하였다. 1944년 4월 4년제 4학급 정원 200명으로 개편되었고, 1945년 10월 131명의 학생으로 재개교하여, 초대 한국인 교장에 김병로(金炳魯)가 취임하였다.
1946년 1월 충무시 북신동 교사로 이전하였으며, 같은 해 6월 제1회 졸업생 16명을 배출하였다. 1951년 8월 「교육법」 개정에 따라 통영중학교와 통영고등학교로 분리, 개편되어 고등학교는 3년제 9학급 정원 450명을 편성하였다. 같은 해 11월충무시 동호동으로 이전하였다가 1969년 12월에는 다시 현재의 교사를 신축, 이전하였다.
2004년 4월 축구부를 창단하였다.
2008년 현재 31학급에 재학생 1,132명, 교원 86명이 있고, 제 62회 졸업식을 거행하여 졸업생 346명을 배출하였고, 총졸업생수는 1만 8천여명이다. 교육목표는 ‘실력을 길러 꿈을 실현하는 인재육성’이며 교훈은 ‘참되게 배우고 슬기롭게 살자’로 설정하여 이의 실천에 힘쓰고 있다.
역점과제로 자기주도적 학습을 위한 지원활동 강화, 효행·전통문화 계승을 통한 바른 인성함양과 교육감 지정 지속가능발전교육 시범학교를 운영하고 있으며, 특색교육활동으로 매월 한 편씩 명시 암송을 통한 지성인 기르기 활동을 실시하고 있다.