궁중에는 왕실의 병을 치료하고 의약의 제조를 관장하는 내의원(內醫院)이 있으나, 만일 그 병이 중태일 경우에는 임시로 시약청이나 의약청(議藥廳)을 특설하여 내의원 소속 이외의 의관이나 침의(針醫)·의방(醫方)에 능통한 신하들을 참여시켜 치료·투약에 대한 상의를 하여 만전을 기하게 하였다.
정확한 설치연대는 밝히기 어려우나 1565년(명종 20) 9월 왕의 질병을 치료하기 위하여 설치되었다가 한 달 뒤에 파하였다는 기록이 보이고, 1618년(광해군 10) 2월 왕비의 병후(病候)로, 1674년(현종 15) 2월 왕의 중환으로, 1821년(순조 21) 3월 왕대비의 병으로, 1834년 순조의 위독으로 시약청이 설치된 기록 등이 실록에 보인다.
비록 임시치료기관이지만, 왕이나 왕비 및 왕대비의 치료를 맡은 중요한 임무를 띤 관청이므로 그 조직의 범위는 매우 광범위하여 도제조(都提調)·제조·부제조·장무관(掌務官)·침의·제약관(劑藥官)·의녀(醫女)·서원(書員) 등의 수많은 관원이 배치되었다.