1937년 4월 진도농업실수학교로 설립되었다. 1946년 10월 진도농업중학교로 개편되었다가 1951년 8월 학제변경에 따라 6학급의 진도농업고등학교로 다시 개편되었다. 1967년 10월 진도실업고등학교로 개칭하고 농과 · 축산과, 상과 각 1학급씩 총 9학급을 설치하였다.
1980년 9월 농과 2학급, 축산과 1학급, 상과 3학급의 총 18학급으로 확장하였다. 1992년 8월에 농업전산과, 1994년 원예과 · 사무자동화과 · 자동차과를 인가를 받았다. 1997년 3월 진도여종고를 흡수하여 통폐합하였다. 2013년에는 전남도교육청 지원형 특성화고등학교로 지정되었다.
2025년 현재 교육과정은 사무행정과, 드론기계과, 특수학급으로 편성되어 있으며, 9,800여명의 졸업생을 배출하였다.
‘성실’의 교훈 아래 교육목표를 ‘애국인ㆍ도덕인ㆍ실력인ㆍ기능인ㆍ건강인’의 양성에 두고 있다. 매년 5월에 ‘첨찰종합예술제, 춘계체육대회, 교내백일장 대회, 10월에 추계체육대회 등을 개최하고 있다.
그 밖에도 영농학생경진대회를 개최하여 영농설계발표 및 농기계경진을 통한 영농기술 증진에 힘쓰고 있으며, 교내 컴퓨터 경진대회, 교내 기능왕 경진대회 등을 개최하여 정보사회에 대처하여 나갈 수 있는 전문 기능인 육성 및 전원 자격증 취득에 노력하고 있다. 특색사업으로는 진도무형유산 계승, 근대 3종 경기 육성을 하고 있고, 상설클럽활동 등을 운영하고 있다.