생화학과 이에 관련되는 학문의 연구를 통하여 생명과학발전에 기여하기 위하여 이학·의학·약학·농학 분야의 생화학자들이 중심이 되어 1967년 8월 서울에서 설립되었다.
설립 이후 매년 2회의 학술대회를 개최하였으며, 그 내용은 주로 생화학연구에 관한 것인데, 최근에는 유전공학에 관한 연구논문이 많아졌다. 1968년부터 학술지 ≪Journal of Biochemistry and Molecular Biology≫를 연6회 발간하여 2001년현재 제34권 2호까지 발간하였다.
1981년부터는 연4회 ≪생화학뉴스≫를 발행하고 있으며, 단행본으로는 1973년에 ≪실험생화학≫을, 1986년에 ≪생화학총설집≫과 ≪유전자재조합 실용화연구≫를 발간하였다. 한편, 국제적인 학술교류를 위하여 1973년에 아시아·대양주생화학연맹(FAOB)에 가입하였고, 1981년에는 국제생화학연맹(IUB)에 회원국으로 가입하였다.
정회원자격은 생화학과 이에 관련된 생명과학을 전공하는 연구소의 연구원 및 석사과정을 이수한 전임강사 이상의 사람이며, 특별회원은 평의원회에서 가입이 의결된 개인 또는 단체로 하고 있다. 2001년 현재 회원총수는 1,533명이며, 사무실은 서울특별시 강남구 역삼동의 한국과학기술회관내에 있다.