1907년 11월에 전 한국학부령에 의거 창립인가를 받았고, 1908년 11월 3일 사립 학교령에 의해 창립되었으며, 1909년 3월16일에 사립문흥학교로 개교하였다. 1907년에도 이미 학생이 있었던 것으로 추정하여 동문들은 2007년 10월 3일에 개교 100주년을 맞이하였음을 축하하는 기념식을 올렸다.
1909년 12월 14일에 사립학교 인가, 1912년 4월 1일에 공립보통학교 설립인가 후 1912년 4월 1일에 공립학교 4년제 (2학급)이 개교하였으며, 이듬해 1913년 3월 25일에 첫 졸업생 8명이 배출되었다. 1926년 3월 29일 6년제 제도가 시행되고 3학급이 편성되고, 1938년 4월 1일에 문의심상소학교로 개명되었고, 1941년 4월 1일 문의공립국민학교로 개명되었다.
1949년 9월 1일 문의국민학교로 개명되었고, 1973년 2월 13일(제60회 졸업식)에는 263명의 졸업생을 배출하기도 하였다. 1979년 11월 15일에 대청댐 수몰로 학교를 미천리 228번지 현 위치에 신축 공사를 하였으며, 1980년 3월 1일에는 구룡분교장이 분리 독립하였고, 1980년 6월 2일에 학교를 이전하였다.
1981년 3월 10일 문의국민학교 병설유치원 1학급이 설립 인가되었으며, 1990년 3월 1일에는 구룡, 소전, 회서국민학교가 분교로 격하되었고, 1992년 3월 1일에 구룡, 회서 분교장이 본교에 통합되었다. 1996년 3월 1일 문의초등학교로 개명되었고, 1999년 3월 1일에 소전 분교가 본교에 통합되었으며. 9월 1일에는 도원초등학교가 본교 분교장으로 편입되었다.
2000년 10월 16일 홍익초등학교와 도농간 교류학습을 전개하였고, 2006년 4월 20일에 미국 LA 성 제임스학교와 자매결연을 맺었다. 2007년 10월 3일 100주년 기념식을 가졌다.
건강하고(體) 참되며(德) 슬기로운(智) 어린이를 기르기 위해 새로운 100년의 꿈을 열어가는 문의교육을 추진하고 있다. 2009년 9월부터 농산촌 전원학교 육성사업 지원학교로 지정되어 학교의 시설과 여건 및 교육활동의 혁신을 꾀하고 있으며, 도원분교를 포함하여 아토피 예방 및 치료 시범학교를 운영하게 되었다.
2010년 3월 현재 6학급(분교 4학급)에 학생 174명, 교직원 29명이다. 2010년 제97회 졸업식을 하였고, 총 8,685명의 졸업생을 배출하였다.