1927년 4월에 3년제 김해공립농업학교로 설립되어, 같은해 5월 김해시 합성동에서 개교하였다. 1931년 3월에 5년제로 수업연한을 연장하고, 1941년 구산동으로 교사를 이전하였다. 광복과 더불어 6년제 김해농업중학교로 재개교하여, 초대교장에 황오윤이 취임하였다.
1950년 5월에 학제개편에 따라 김해농업고등학교로 개편되었으며, 1951년 9월에는 기존의 농업과 외에 축산과와 임업과를 증설하였다가 1954년 폐과하였다. 다시 1961년에 축산과, 1964년에 원예과를 신설하고, 1964년 12월에 교명을 김해농림학교로 변경하였다.
1968년 12월에 김해농공고등학교로, 1978년 1월에 김해농업고등학교로 개칭하고, 1981년 3월에 현재의 위치로 교사를 이전하였다. 2001년부터 현재까지 특성화 고등학교로 지정 운영되었다. 2006년 김해생명과학고등학교로 교명이 변경되었고, 동년 8월 식품가공과, 농산기계과가 각각 1학급 증설되었다. 2008년에는 제37년차 전국FFK 전진대회 개최한 바 있다.
교훈은 ‘성실’이며, ‘미래사회를 주도할 성실하고, 창의적인 국제화 기능인 육성’이라는 교육목표 아래 기초와 기본 학력 신장과 기초 질서를 지키는 인성교육 강화 특성화 교육 과정 운영의 내실화에 교육력을 모으고 있다.
2008년 특성화고등학교 운영으로는 1학년 진로희망 및 졸업생 진로분석을 통한 학습증설 또는 학과별 학생 선택권 수용과 특성화 교과개발 완료 및 승인, 농기계실 신축, 실습동 전면 개보수, 식품조리실습실 신설, 급식소 및 생활관 완공, 제37년차 전국FFK 전진대회 개최를 통하여 농업교육의 전등으로 발돋움하고 있다.
2008년 현재 국제농축산개발과 9학급, 도시원예학과 9학급, 농산업기계과 6학급, 식품가공과 6학급에 재학생 841명, 교원 69명이다. 졸업생은 총 78회 총 1만 5,687을 배출하였다.