인류 및 포유동물의 생식이론과 그 응용에 관한 연구를 통하여 불임학의 발전과 인류복지에 기여하며, 회원 상호간의 친목을 도모할 목적으로 나건영(羅建榮) 등이 중심이 되어 1972년 7월 설립되었다.
원래 이 학회는 1971년 10월 17일부터 25일까지 일본 동경(東京)에서 개최된 제7차국제불임학회에 참석하였던 나건영·곽현모(郭顯模)·이희영(李熙永)·강대선(姜大善) 등 24명 중 19명이 모여 가칭 대한불임학회 발기인총회를 거쳐 창립된 것인데, 설립 이후 학회지 발간 등 본격적인 활동을 전개하였다.
매년 4월, 8월, 12월에 걸쳐 3회 학회지를 발간하여 1998년 11월 현재 제25권 제2호가 발간되었고, 매년 봄, 가을 2회의 학술대회를 개최하고 있다. 춘계학술대회는 특강과 심포지움으로 구성되며, 추계학술대회는 특강과 심포지움 이외에 자유연제를 발표하여 회원간의 학술교류와 학문발전에 힘쓰고 있다.
또한, 매년 임상의학 및 자연과학 분야에서 각각 우수한 논문을 선정하여 추계학술대회에서 학술상을 시상하고 있다. 특히, 1998년 샌프란시스코(Sanfrancisco)에서 열린 세계불임학회에서 본 학회가 학술분과 위원국으로 선출되어 세계불임학회서 대한민국의 위상이 한층 더해졌다.
회원은 정회원과 명예회원으로 구분되는데, 정회원은 이 방면의 연구에 종사하며 학회 목적에 찬동하여 입회를 원한 자이고, 명예회원은 학회 사업을 위하여 공로가 있는 자로서 이사회의 승인을 얻어 추대되며, 정회원총수는 1998년 현재 700명이다. 학회사무실은 서울특별시 서대문구 신촌동 134번지에 있다.