1977년 6월 동주여자실업전문학교 설립계획 승인받아 1977년 7월 학교법인 석파학원 설립하고, 초대 이사장으로는 정종섭 이사장이 취임하였다.
1978년 3월 동주여자실업전문학교를 개교하였다. 6개 학과 학생정원 480명으로 설립인가. 가정과, 보육과, 의상과, 상업디자인과, 관광과, 전자계산과(각과 정원 80명)를 두었다.
1979년 1월 동주여자전문대학으로 교명을 변경하였다. 1981년 10월 동주여자전문대학 부속유치원 설치하였다. 1995년 중앙도서관 및 박물관을 준공하였다. 1998년 동주대학으로 교명을 변경하였다.
2011년 동주대학에서 동주대학교로 교명을 변경하였다.
2022년 11월 25일 부산보건대학교로 교명변경 인가를 받고 2023년 3월 1일부터 새로운 교명을 사용하기 시작하였다.
건학이념은 ‘진리(眞理) · 정의(正義) · 창의(創意)의 교시(敎是)와 무한불성(無汗不成)의 동주정신을 바탕으로 참되고 바르고 창의적인 전문직업인으로서의 능력과 품성을 도야한다’이다.
2000년 10월에는 석파미술관을 개관하였으며 동년 11월에는 물리치료과, 치위생과를 신설하였다. 2002년 10월에는 작업치료과, 사회복지과, 보건행정과를 신설하였으며, 2004년 10월에는 응급구조과, 의료기공학과, 문화관광이벤트과, 유아특수보육과, 아동미술과를 신설하였다. 2005년 11월에는 아동영어과를 신설하였으며, 2006년 10월에는 재활요양관리과, 방과후아동지도과, 패션스타일리스트/쥬얼리과,재활요양관리과, 방과후아동지도과, 패션스타일리스트/쥬얼리과 신설하였다. 2007년 10월에는 자동차튜닝과를 신설하였다.
2014년에는 5개 학부(국제관광경영학부, 디자인 · 미디어학부, 공학부, 교육 · 복지학부, 보건건강학부), 3개 계열(호텔 · 관광계열, 항공항만경영계열, 미용계열), 25개 학과로 구성되어 있으며, 부속기관으로는 국제교류센터, 석파미술관, 동주대학체육관, 미디어센터, 동주생활관, 부속유치원 등이 있으며 산학협력단으로 환경보건연구소, 정보통신연구소, 경영연구소, 관광서비스교육센터, 동주문화개발연구소 등이 있다.
2023년 현재 인문사회계열(5개과 및 2개 전공), 자연과학계열(10개과 및 미용계열 3개 전공), 공학계열(1개과), 예체능계열(3개과) 등 4계열, 21개 학과, 5개 전공으로 구성되어 있다. 부속기관은 국제교류센터, 석파박물관, 석파동주체육관, 미디어센터, 부산보건생활관, 인권센터, 창업지원단, 평생교육원, 도서관, 중앙전산소 등이 있고, 부설연구소는 관광서비스교육센터, 영유아교육연구소, 서부산미술치료연구소, 운전재활연구소 등이 있다.