1946년 10월 20일에 청산공립초급중학교로 개교하여, 1950년 6월 1일에 청산중학교로 교명을 변경하였다. 1977년 12월 31일에 남자 중·고와 여자 중·고로 분리하였으며, 1986년 3월 1일에 남녀공학인 청산중학교와 청산고등학교로 분리·개편하였다. 1997년 6월 12일에 건평 708m2의 강당을 완공하였다. 2004년 2월 23일에 과학실 현대화 사업을 완료하였고, 2006년 2월 10일에 장애인 편의시설을 완공하였다. 2006년 10월 30일에 ‘네모난 친구’ 도서관을, 2007년 12월 10일에 영어학습전용교실(English Zone)을 개관하였다. 2008년 11월부터 12월까지 체험학습장을 조성하였다. 2009년 3월부터 7월까지 진입로를 확·포장하는 한편, 교문을 개축하였다.
교육목표는 ‘알찬 실력과 아름다운 마음씨를 갈고 다듬는 학생’이다. 학생상은 ‘창의와 슬기’이고, 교사상은 ‘보람과 긍지’이며, 학교상은 ‘신뢰받는 학교’이다. 교훈(校訓)은 ‘성실독행’이고, 교목(校木)은 ‘벽오동’, 교화(校花)는 ‘개나리’이다.
2000년 3월부터 2002년 2월까지 ‘충청북도교육청 지정 시범학교’를 운영하였다. 2007년 12월 20일에 ‘2007년 학교평가 우수학교’로 선정되었고, 2008년 3월부터 12월까지 ‘2008년 방과 후 학교 시범학교’를 운영하였다. 2009년 8월에 ‘교육과학기술부 지정 농산어촌 전원학교’로 선정되었다.
2016년 4월 1일 기준으로 총 53명이 재학 중이며, 교원은 총 19명이다. 2016년 2월 12일에 16명으로 졸업식을 거행하였으며, 지금까지 누적된 졸업생 수는 총 1만 430명에 달한다.