1948년 구룡포중학원 설립인가를 받았고, 1948년 5월 10일 재단법인 구룡포교육재단이 인가와 함께 중학교 6학급 인가를 받았다. 1951년 8월 31일 구룡포수산고등학교 병설 인가를 받아 장기택 교장이 취임하였다. 1971년 3월 1일 학교법인 구룡포 교육재단을 해체하고 공립중등학교(어업과 3학급, 상업과 3학급)로 전환하였다.
1972년 구룡포실업고등학교로 교명을 변경하였고, 1976년 3월 1일 구룡포종합고등학교로 교명을 변경하였다. 1983년 3월 1일 구룡포여자중학교와 구룡포종합고등학교가 분리되었고, 1986년 3월 1일 보통과 1학급을 증설하였다(어업과 3학급, 보통과 6학급). 1993년 3월 1일 기관과를 신설하였고, 1998년 3월 1일 어업과를 해양생산과로, 기관과를 동력기계과로 학과 명칭을 변경하였다.
2010년 3월 당시 8학급(해양생산과 3학급, 동력기계과 3학급, 보통과 2학급)으로 편성되었으며, 재학생은 163명이며, 교직원은 20명으로 구성되어 있다. 졸업생은 2010년 2월 제58회 졸업식을 하였고, 총 4,587명의 졸업생을 배출하였다.
2012년 3월 구룡포종합고등학교가 포항과학기술고등학교로 교명을 변경하며 새롭게 출범하였다.
교훈은 ‘건전한 정신에 바르게 배우자’이다. 교목은 해송이며, 교화는 해당화이다. 그동안 구룡포 지역의 오랜 역사와 전통을 지닌 명문학교로서 지역 인재발굴과 육성에 힘쓰고 있다. 90% 이상의 학생들이 어로기능사, 해기사, 동력기계정비기능사, 워드프로세서 등의 정보화 관련 자격증을 취득하고 있다.
최근엔 방과후학교 시범(2009년), 학생상담 학교 시범(2010년)을 통해 지역 교육을 선도하고 있다. 또한 매년 ‘사라축제’를 통해 다채로운 학예활동을 펼치고 있으며, 구룡컴동아리, 자동차연구회 등의 동아리 활동이 이루어지고 있다.