1913년 5월 1일 이인사립삼흥학교로 개교하였다. 1917년 4월 1일 이인공립보통학교로 인가를 받았다. 1938년 4월 1일 이인공립심상소학교로, 1941년 4월 1일 이인국민학교로 각각 개명하였다. 1947년 11월 15일 태봉국민학교를, 1949년 9월 30일 주봉국민학교를 분리하여 개설하였다. 1981년 3월 6일 병설유치원 1학급을 개원하였다. 1996년 본교는 이인초등학교로 교명을 변경하였다.
교훈은 ‘바르게 살자’이며, 교목은 은행나무, 교화는 영산홍이다. 교육목표는 ‘몸과 마음이 조화를 이룬 개성 있는 사람, 기초와 기본을 토대로 창의력을 발휘하는 사람, 학습 경험을 바탕으로 진로를 개척하는 사람, 전통 문화 위에 새로운 가치를 창조하는 사람, 이웃과 나라의 발전을 위해 봉사하는 사람’을 양성하는 것이다. 본교는 방과후 학교로서 서예, 한국화, 영어회화, 컴퓨터, 사물놀이, 한자반 등을 운영하고 있다.
2010년 현재 6학급이 개설되어 있으며 남학생 42명과 여학생 23명 등 총 65명이 재학 중이다. 유치원에는 1학급이 개설되어 있고 남자 9명과 여자 5명 등 총 14명이 재원 중이다. 본교 교직원은 교사 14명과 행정직원 5명을 비롯해 총 14명이 재직 중이다. 2010년 2월 11일 제91회 졸업식을 거행하여 졸업생 7명을 배출하였으며, 지금까지 누적된 졸업자 수는 총 5,476명이다.