농업 분야 관리자 양성과 재교육을 위하여 설립되었다. 1947년 3월 11일 북조선농업간부양성소라는 이름으로 설립되어 1958년 2월 10일에 농업성간부학교, 1967년 9월 15일 농업위원회 중앙간부학교, 1990년 10월 31일 농업간부재교육대학, 1994년 8월 11일 김보현대학으로 개칭되었다.
북한에서 경제 분야 간부학교로서는 첫 번째 세워졌으며, 한국전쟁 이후 북한이 협동농장화를 추진 하던 무렵 이 학교 출신이 큰 역할을 했다.
그간 수만 명의 농업관리자를 양성했으며, 현재 농업경영학과에서는 농업기사 자격을 부여하여 농업관리자 재교육을 위한 재직반, 농업재정부기 전문반, 농업설계 전문반이 있다.
1994년 대동강변에서 현재 위치로 이전하면서 연건평 14,000㎡의 건물을 신축하였다.