1책이다. 표제(表題)는 『호법질의록(護法質疑錄)』이라 되어있다.
금명보정이 천문·보조 지눌·선교·염불 등 7개의 주제를 정하여 찬술하였다. 「인간오십년하천일주야변(人間五十年下天一晝夜卞)」·「일행장단변(日行長短卞)」·「월륜결원변(月輪缺圓卞)」·「대경자수변결의변(大經字數卞決疑卞)」·「고성염불격금타고변설(高聲念佛擊金打鼓卞說)」·「수미산개론(須彌山槪論)」·「조수증감변(潮水增減卞)」은 질문에 대한 답변 형식이며, 내용은 경론(經論)을 인용하여 자신의 견해를 덧붙이고 있다. 예컨대 우주 운행의 시간대와 인생을 대비시키거나 선과 교, 염불정토 등 다양한 내용을 수록하고 있다.
특히 보조국사 지눌에 대해서는 그의 생애와 함께 수행을 소개하였는데, 송광사뿐만 아니라 한국 불교사에서 지눌이 지닌 가치를 반영한 것이다. 이와 같은 모습은 그가 지눌의 저술로 해석한 『염불요문(念佛要門)』에 대한 주석서인 『염불요문과해(念佛要門科解)』를 찬술하는 과정에서도 나타난다. 대표적인 저서로는 『질의록』 외에도 『조계고승전』, 『저역총보(著譯叢譜)』, 『다송시고(茶松詩稿)』 등 다수가 있다.