본관은 완산(完山). 자는 수보(壽甫). 우리나라에서 처음으로 실시한 인두종법(人痘種法)을 박제가(朴齊家)로부터 배워 동생 이종원(李鍾元)과 같이 많은 사람에게 종두법을 시술하여 두창(痘瘡)을 예방하였다.
1817년(순조 17) 널리 중국의 종두전문의서를 보고 종두법과 치두방(治痘方)을 참고로 하여 『시종통편(時種通編)』을 저술하여 간행하였다.
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