신교육을 통하여 민족정신과 근대 시민의식을 함양하기 위해서 설립되었다. 1914년 4월 1일 사립문창학교로 개교하여 1918년 문산공립보통학교로 전환되었다. 1984년 병설유치원을 개원하였고, 1996년 문산초등학교로 교명을 변경하였다.
교훈은 ‘참되고 바르고 슬기롭게’이다. 역점사업으로 기초·기본 학력 신장과 틈새독서운동 전개 등 독서·토론·논술 강화에 힘쓰고 있다. 또한 MSES(Munsan Super English School) 운영 등을 통한 기초 생활영어 능력 신장과 단계적 체력 향상 프로그램 운영을 특색사업으로 하고 있다.
2010년 6월 현재 특수학급 2학급을 포함하여 41학급에 총 1,217명의 학생들이 재학하고 있으며, 교직원은 49명이 재직하고 있다. 2010년 2월 제91회 졸업식을 하였고, 총 19,164명의 졸업생을 배출하였다.