1927년 10월 2년제 산청공립농업보습학교로 설립되었다. 1937년 4월 산청공립농업실습학교로, 1942년 4월 산청공립농업전수학교로 교명을 변경하였으며, 1946년 9월 산청공립초급중학교로 개편하였다가, 1950년 9월 다시 산청공립농업중학교로 되었다. 학제변경에 따라 1952년 3월 산청농업고등학교로 개편되어 농업과 3학급을 설치하였고, 1954년 6학급으로 증설하였다. 그 뒤 학생들의 진학률이 늘어남에 따라 1970년 교명을 산청종합고등학교로 개칭하고 보통과 3학급을 증설하였다. 1976년에 다시 축산과 3학급이 증설되어, 3개과에 총 12학급이 편성되었다. 1998년 산청고등학교로 교명을 변경하였다. 2007년에는 산청여자고등학교와 통합하였다.
2008년 현재 보통과 6학급, 자동차과 3학급, 한약자원과 3개 학급 총 322명의 학생이 재학중이며, 교원은 42명이며, 졸업생은 55회 총 5,498명을 배출하였다.
‘품성과 실력으로 미래를 열어가는 인재 육성’이라는 교육목표 아래 2009년에는 교육과학기술부 지정 농산어촌우수고등학교 운영평가 추진 우수학교로 선정되었다. 특색사업은 ‘특별활동과 연계한 동아리 활동의 활성화’로 건전한 여가 문화 및 자신의 자아 실현의 기본을 형성될 수 있도록 하고 있다. 교훈은 ‘성실·협동·창의’이다.