1942년 4월 7일 문산공립농업학교로 설립 인가받아 4월 26일 개교하였다. 1951년 8월 31일 제 1회 졸업식을 하였다. 1951년 9월 8일 현 위치로 이전하였고, 중학교와 고등학교가 병설하였다. 1976년 문산중학교와 문산고등학교로 분리하였다. 1998년괴 1999년에 본관 교사와 교실을 증축하였으며, 2000년 문산중학교 역사관을 개관하였다.
교훈은 '성실'이며, 교목은 잣나무이며, 교조는 까치이고, 교화는 장미이다. 감성교육을 강화하기 위해 글쓰기, 그리기 교육을 중점으로 하고 관내 공공도서관과의 연계를 통한 독서교육 강화에 노력을 중점하고 있다. 외국어 교육의 활성화를 위한 교내 영어 방송을 실시하고 있으며, 국제화 선도학교 프로그램을 운영, 호주, 영국과의 문화 교류를 진행 중이다.
‘1인 1특기 자격증 같기’를 위해 방과 후 학교 활성화를 통한 다양한 자격증 취득반을 개설 운영 중이다. 이 중 비전스쿨은 학교 학생들이 자신의 미래의 모습을 구체화하여 사명선언서를 작성하고, 자신의 삶을 주체적이며 발전적으로 이끌어 갈 수 있도록 설계된 문산중학교의 특성화된 프로그램이다. 학급홈페이지 운영은 심사를 통해 더욱 활발한 활동을 독려하며, 2010년에는 아버지 교실을 운영하여 아버지와 자녀의 친밀도를 높이려 하고 있다.
2010년 3월 현재 32학급에 학생 1,243명, 교직원 63명이다. 2010년 2월 제60회 졸업식을 하였고, 총 20,547명의 졸업생을 배출하였다.