1947년 10월 16일에 삼진중학원으로 개교 설립하였다. 1951년 8월 31일 학제 변경으로 삼진중학교로 개칭되었다. 1990년에 학교법인 해동학원으로 인가받았으며, 1999년 3월 삼진중학교에서 마산삼진중학교로 교명을 변경하였다.
교훈은 ‘성실, 노력’이고, 교육목표는 능력과 바른 심성을 갖춘 창의적인 인간을 육성하는 것이다. 교목은 느티나무, 교화는 철쭉이다. 독서·한자쓰기를 통한 인성 함양, 동료 학생 지도제(tutor) 운영을 통한 기본학력 향상, 영어 팝송 경진대회 등을 통한 의사소통 중심의 생활영어 강화에 주력하고 있다. 역도부는 전국소년체육대회를 비롯한 전국 규모의 대회에서 다수의 입상자를 배출하고 있다.
2010년 4월 현재 12학급으로 편성되어 있으며, 학생 368명, 교원 20명이다. 2010년 2월 제61회 졸업식을 하였고, 총 1만 2,136명의 졸업생을 배출하였다.