본관은 남양(南陽). 수원 출생. 아버지는 충의위(忠義衛) 홍언수(洪彦秀)이다. 용력이 뛰어나고 말달리기·활쏘기를 잘하여 금군(禁軍)에 소속되었다.
1590년(선조 23) 일본에 파견되는 통신사의 군관으로 선발되어 황윤길(黃允吉)·김성일(金誠一) 일행을 따라 일본에 들어갔다가 이듬해 돌아왔다. 관직으로는 경기도조방장, 충청·경상도의 조방장, 수원판관·영천군수 등을 지냈다.
1592년 임진왜란이 일어나자 아버지를 따라 안성에서 의병을 일으켜 인근의 여러 고을로 전전하며 전공을 세워 첨지(僉知)로 승진되었다.
그가 다른 진에 연락차 본진을 떠난 사이 아버지가 왜군을 공격하다가 전사하자, 돌아와 아버지를 대신하여 의병진의 선두에 서서 높은 곳에 성을 쌓고 적정을 정탐하면서 도처에서 유격전도 펼쳤다.
이듬해 다시 군사를 거느리고 전라·경상도 지역으로 진출하여 이빈(李蘋)·선거이(宣居怡)·송대빈(宋大斌) 등과 함께 운봉·남원·진주·구례·경주 등지로 전전하며 전공을 세웠다. 그 뒤 1596년에는 이몽학(李夢鶴)의 반란을 평정하는 데 공을 세우기도 하였다.