본관은 덕수(德水). 자는 무백(茂白). 아버지는 충무공 이순신(李舜臣)이며, 어머니는 보성군수(寶城郡守) 방진(方震)의 딸이다.
1592년(선조 25) 임진왜란이 일어나자 아버지를 따라 한산도해전을 비롯하여 여러 해전에 참가하여 공을 세웠다. 그는 해전에서 뚜렷한 전투공로는 없었으나, 통제사인 아버지를 도와 진중처사에서 자세한 분야에 이르기까지 뒷바라지를 하여 무장들이 불편없이 전투에 임할 수 있도록 배려하는 등 숨은 공로가 많았다.
그러한 그의 숨은 공로가 인정되고, 또한 아버지 이순신이 2품직에 승진하였으므로 국법에 따라 음보(蔭補)로 임실현감에 제수되었다.
곧 통훈대부(通訓大夫)가 되고 이어서 첨정에 승직되었다. 통정대부(通政大夫) 좌승지에 추증되고, 임진왜란의 공으로 선무원종공신(宣武原從功臣)으로 책록되었다.