경주 방내리 고인돌군은 경부고속도로 건천휴게소 신축부지에 대해 1993∼1994년 국립경주문화재연구소(현, 국립경주문화유산연구소)에서 발굴조사를 실시한 청동기시대의 고인돌 유적이다. 이 유적은 남쪽으로 말암산이 인접하고 북쪽으로는 후평들이 펼쳐져 있는 구릉 말단의 경작지에 위치한다.
모두 6기의 고인돌이 산재하는데 덮개돌[上石]의 장축방향은 모두 북서-남동향이다. 가장 크기가 큰 덮개돌은 제2호 고인돌로서 화강암 재질의 장타원형이며 크기는 길이 250㎝, 너비 190㎝, 두께 160㎝, 무게 9.8톤이다. 가장 작은 덮개돌은 제4호 고인돌로서 길이 170㎝, 너비 120㎝, 두께 60㎝이다. 제1∼3호 고인돌에서는 각 두 매씩의 굄돌[支石]이 남아 있었다. 고인돌의 하부구조인 무덤방의 평면 형태는 긴네모모양[長方形] 3기(제1·5·6호), 타원형 · 원형 3기(제2·3·4호)로 구분된다. 이중에서 냇돌을 사용하여 1∼2단 정도 비교적 엉성하게 축조한 유사돌덧널[類似石槨]의 형태는 제1·3·5·6호가 해당한다. 돌덧널의 내부에는 흑갈색 점토와 10㎝ 정도 크기의 잔자갈을 깔았다.
출토된 유물은 6호 고인돌에서 민무늬토기조각[無文土器片] 1점만이 출토되었다.
방내리 고인돌군은 청동기시대 유적으로서 출토유물이 빈약하여 그 정확한 편년에는 한계가 있다. 이 고인돌 유적은 경주 다산리 고인돌, 영천 용산동 고인돌 유적과 더불어 고인돌 하부구조가 뚜렷하지 못한 유사돌덧널 형태를 지닌 몇 안되는 유적으로 평가된다.