부산정치파동에서 민중자결단의 활동은 관제 시위와 민의 조작을 통해 대통령직선제 개헌을 반대하고 주3 개헌을 추진하는 국회의원들을 압박하는데 집중되었다. 이들은 1952년 5월 24일 대규모 인원을 동원해 민중자결선포대회를 개최하였고, 6월 9일에는 국회 해산을 요구하는 민중자결선포전국대표자대회를 열었다. 이들의 활동은 매우 조직적이고 폭력적이었는데 5월 24일 시위에서는 머리에 흰 수건을 두르고 죽창을 들었다. 6월 28일에도 임시 국회의사당을 포위한 채 직선제 개헌안 통과와 국회 해산을 주장하며 의원들의 출입을 막아 의원 7~80명이 연금당하고 일부 의원들은 부상을 입었다. 6월 30일에는 전국민중자결시군대표자회의 명의로 국회 해산 및 즉각적인 총선거 실시를 요구하는 최후통첩을 이승만에게 제출하였다.
대통령직선제 개헌안이 통과된 후에도 민중자결단의 관제 민의 동원 활동은 계속되었다. 이들은 제2대 정부통령선거를 앞두고 이승만의 대통령선거 출마를 권고하는 340만여 장의 연판장을 가지고 임시경무대 앞에서 농성투쟁을 벌였다. 부통령 후보로는 백성욱을 지지하였다. 제2대 국회 말에는 개헌운동에 앞장섰다. 민중자결단은 1953년 6월 9일 대국회 건의안을 발표해 이승만이 주장하는 국회의원 주4와 대통령에게 주5을 부여하는 개헌을 요구하였고, 1954년 3월 들어 일부 정치세력과 제휴해 초대 대통령의 종신 집정을 포함한 개헌 공작을 전개하였다. 4월 19일에는 자유당 등과 함께 개헌추진위원회를 구성하였다. 이때 검토한 개헌 조항은 초대 대통령에 대한 중임 제한 철폐, 국민투표제와 국회의원 소환제, 정부에 국회해산권 부여, 경제조항 개정 등이었는데, 제3대 총선 이후 일부 조정을 거쳐 11월 28일 자유당에 의해 통과되었다. 1950년대 후반에도 민중자결단은 1956년 제3대 정부통령선거에서 자유당의 선거운동에 동원되는 등 자유당의 외곽조직으로 활용되었다.
민중자결단은 1952년 부산정치파동 때 대중동원을 통해 의회내 야당 세력을 압박함으로써 이승만 대통령이 추진하는 직선제 개헌안을 통과시키기 위해 조직되었다. 민중자결단의 활동은 부산정치파동의 폭력적 측면과 함께 집권 초기 의회 내에서 안정적 기반을 갖지 못한 이승만 대통령이 원외 대중단체들을 활용해 구사하는 ‘동원의 정치’의 실상을 잘 보여준다. 1954년 제3대 총선을 통해 자유당이 의회를 장악함으로써 민중자결단의 역할은 줄어들었다. 하지만 그 후에도 계속해서 민중자결단은 이승만 대통령의 권력 유지를 위한 보조적 수단으로 이용되었다.